三笠号在1899年1月24日在威格士造船厂动工。3月1日在修咸顿举行交接仪式交予日本海军。7月17日到达本籍港舞鹤。

1903年12月28日，三笠号成为联合舰队旗舰。1904年2月6日开始参加日俄战争。8月10日参加黄海海战。12月28日驶入吴港修理。1905年2月21日到达镇海湾，之后以该地为据点，在对马海峡进行训练。5月27日、28日在对马海峡海战与俄罗斯的波罗的海舰队交战。三笠在对马海峡海战带领日本联合舰队在历史上进入一场最果断的海战，俄国舰队几乎完全地被歼灭。另一方面，日本人只丧失了116个人和3艘鱼雷艇。

1905年9月11日，三笠号在佐世保港内因为后部弹药库的爆炸事故而沉没，这个事故中死者共339名。1906年8月8日打捞到佐世保工厂修理，1908年4月24日第1舰队旗舰再次回复现役。

1914年根据华盛顿海军条约使三笠决定废舰。1923年9月1日因为关东大地震令三笠号撞到码头、浸水，9月20日于帝国海军除籍。

根据华盛顿海军条约废舰后，由于日本国民对三笠号的保存运动非常热心，日本将解体的地方作为三笠公园，并经多方努力保存之下，保留至今。